Python利用PyVista進(jìn)行mesh的色彩映射的實(shí)現(xiàn)

最近項(xiàng)目中需要對mesh做一個(gè)色彩映射，無意間發(fā)現(xiàn)vtk的封裝庫pyvista相當(dāng)好用，就試了試，在此做一個(gè)總結(jié)。

PyVista簡介

PyVista是什么

PyVista 是一個(gè)：

• VTK for humans”， 可視化工具包(VTK)的高級API
• 空間數(shù)據(jù)的網(wǎng)格數(shù)據(jù)結(jié)構(gòu)與濾波方法
• 使3D繪圖更加簡單，可用于大型/復(fù)雜數(shù)據(jù)的圖像化

PyVista(以前的vtki)是可視化工具包(VTK)的一個(gè)助手模塊，它采用了一種不同的方法，通過NumPy和直接數(shù)組訪問與VTK進(jìn)行接口。這個(gè)包提供了一個(gè)python化的、文檔化良好的接口，展示了VTK強(qiáng)大的可視化后端，以方便對空間引用的數(shù)據(jù)集進(jìn)行快速原型化、分析和可視化集成。

該模塊可用于演示文稿和研究論文的科學(xué)繪圖，以及其他依賴網(wǎng)格的Python模塊的支持模塊。

參考：https://docs.pyvista.org/index.html

github

官方教程

pyvista和其他3D可視化工具比較

參考：https://github.com/pyvista/pyvista/issues/146

pyvista使用

安裝

pip install pyvista -i https://pypi.tuna.tsinghua.edu.cn/simple

I/O讀取及可視化

mesh類型

pyvista支持讀取大多數(shù)常見的mesh文件類型，比如PLY，VTK，STL ,OBJ ,BYU 等，一些不常見的mesh文件類型，比如FEniCS/Dolfin_ XML format

（很遺憾，pyvista不支持點(diǎn)云PCD格式，不過可以通過pcdpy、pclpy、python-pcl等庫來讀取pcd文件）

import pyvista as pv
# 讀取
mesh = pv.read('pointCloudData/data.vtk')
# 顯示
mesh.plot()
# 其他類似
mesh = pv.read('pointCloudData/data.ply')
……

圖片類型

支持讀取圖片類型數(shù)據(jù)JPEG, TIFF, PNG等

# 讀取
image = pv.read('my_image.jpg')
# 顯示
image.plot(rgb=True, cpos="xy")

# 其余圖片類型類似
……

mesh彩色映射

項(xiàng)目中需要用到根據(jù)高度來對mesh進(jìn)行彩色映射，在pyvista中大概有四種方法

自定義

代碼

import pyvista as pv
import matplotlib.pyplot as plt
from matplotlib.colors import ListedColormap
import numpy as np

def mesh_cmp_custom(mesh, name):
 """
 自定義色彩映射
 :param mesh: 輸入mesh
 :param name: 比較數(shù)據(jù)的名字
 :return:
 """
 pts = mesh.points
 mesh[name] = pts[:, 1]
 # Define the colors we want to use
 blue = np.array([12 / 256, 238 / 256, 246 / 256, 1])
 black = np.array([11 / 256, 11 / 256, 11 / 256, 1])
 grey = np.array([189 / 256, 189 / 256, 189 / 256, 1])
 yellow = np.array([255 / 256, 247 / 256, 0 / 256, 1])
 red = np.array([1, 0, 0, 1])

 c_min = mesh[name].min()
 c_max = mesh[name].max()
 c_scale = c_max - c_min

 mapping = np.linspace(c_min, c_max, 256)
 newcolors = np.empty((256, 4))
 newcolors[mapping >= (c_scale * 0.8 + c_min)] = red
 newcolors[mapping  (c_scale * 0.8 + c_min)] = grey
 newcolors[mapping  (c_scale * 0.55 + c_min)] = yellow
 newcolors[mapping  (c_scale * 0.3 + c_min)] = blue
 newcolors[mapping  (c_scale * 0.1 + c_min)] = black

 # Make the colormap from the listed colors
 my_colormap = ListedColormap(newcolors)
 mesh.plot(scalars=name, cmap=my_colormap)

if __name__ == '__main__':
 mesh = pv.read('pointCloudData/1.ply')
 mesh_cmp_custom(mesh, 'y_height')

效果：

使用pyvista自帶的cmp

函數(shù)mesh.plot(scalars=name, cmap='viridis_r')

其中cmap支持的樣式：

‘Accent', ‘Accent_r', ‘Blues', ‘Blues_r', ‘BrBG', ‘BrBG_r', ‘BuGn', ‘BuGn_r', ‘BuPu', ‘BuPu_r', ‘CMRmap', ‘CMRmap_r', ‘Dark2', ‘Dark2_r', ‘GnBu', ‘GnBu_r', ‘Greens', ‘Greens_r', ‘Greys', ‘Greys_r', ‘OrRd', ‘OrRd_r', ‘Oranges', ‘Oranges_r', ‘PRGn', ‘PRGn_r', ‘Paired', ‘Paired_r', ‘Pastel1', ‘Pastel1_r', ‘Pastel2', ‘Pastel2_r', ‘PiYG', ‘PiYG_r', ‘PuBu', ‘PuBuGn', ‘PuBuGn_r', ‘PuBu_r', ‘PuOr', ‘PuOr_r', ‘PuRd', ‘PuRd_r', ‘Purples', ‘Purples_r', ‘RdBu', ‘RdBu_r', ‘RdGy', ‘RdGy_r', ‘RdPu', ‘RdPu_r', ‘RdYlBu', ‘RdYlBu_r', ‘RdYlGn', ‘RdYlGn_r', ‘Reds', ‘Reds_r', ‘Set1', ‘Set1_r', ‘Set2', ‘Set2_r', ‘Set3', ‘Set3_r', ‘Spectral', ‘Spectral_r', ‘Wistia', ‘Wistia_r', ‘YlGn', ‘YlGnBu', ‘YlGnBu_r', ‘YlGn_r', ‘YlOrBr', ‘YlOrBr_r', ‘YlOrRd', ‘YlOrRd_r', ‘a(chǎn)fmhot', ‘a(chǎn)fmhot_r', ‘a(chǎn)utumn', ‘a(chǎn)utumn_r', ‘binary', ‘binary_r', ‘bone', ‘bone_r', ‘brg', ‘brg_r', ‘bwr', ‘bwr_r', ‘cividis', ‘cividis_r', ‘cool', ‘cool_r', ‘coolwarm', ‘coolwarm_r', ‘copper', ‘copper_r', ‘cubehelix', ‘cubehelix_r', ‘flag', ‘flag_r', ‘gist_earth', ‘gist_earth_r', ‘gist_gray', ‘gist_gray_r', ‘gist_heat', ‘gist_heat_r', ‘gist_ncar', ‘gist_ncar_r', ‘gist_rainbow', ‘gist_rainbow_r', ‘gist_stern', ‘gist_stern_r', ‘gist_yarg', ‘gist_yarg_r', ‘gnuplot', ‘gnuplot2', ‘gnuplot2_r', ‘gnuplot_r', ‘gray', ‘gray_r', ‘hot', ‘hot_r', ‘hsv', ‘hsv_r', ‘inferno', ‘inferno_r', ‘jet', ‘jet_r', ‘magma', ‘magma_r', ‘nipy_spectral', ‘nipy_spectral_r', ‘ocean', ‘ocean_r', ‘pink', ‘pink_r', ‘plasma', ‘plasma_r', ‘prism', ‘prism_r', ‘rainbow', ‘rainbow_r', ‘seismic', ‘seismic_r', ‘spring', ‘spring_r', ‘summer', ‘summer_r', ‘tab10', ‘tab10_r', ‘tab20', ‘tab20_r', ‘tab20b', ‘tab20b_r', ‘tab20c', ‘tab20c_r', ‘terrain', ‘terrain_r', ‘turbo', ‘turbo_r', ‘twilight', ‘twilight_r', ‘twilight_shifted', ‘twilight_shifted_r', ‘viridis', ‘viridis_r', ‘winter', ‘winter_r'

代碼

import pyvista as pv
def mesh_cmp(mesh, name):
 """
  使用進(jìn)行plot自帶的色彩映射
  :param mesh: 輸入mesh
  :param name: 比較數(shù)據(jù)的名字
  :return:
 """
 pts = mesh.points
 mesh[name] = pts[:, 1]
 mesh.plot(scalars=name, cmap='viridis_r')
 
if __name__ == '__main__':
 mesh = pv.read('vtkData/airplane.ply')
 mesh_cmp(mesh, 'y_height')

效果

使用Matplotlib的cmp

代碼

import pyvista as pv
import matplotlib.pyplot as plt

def mesh_cmp_mpl(mesh, name):
 """
  使用Matplotlib進(jìn)行色彩映射
  :param mesh: 輸入mesh
  :param name: 比較數(shù)據(jù)的名字
  :return:
  """
 pts = mesh.points
 mesh[name] = pts[:, 1]
 mlp_cmap = plt.cm.get_cmap("viridis", 25)
 mesh.plot(scalars=name, cmap=mlp_cmap)
 
if __name__ == '__main__':
 mesh = pv.read('vtkData/airplane.ply')
 mesh_cmp_mpl(mesh, 'y_height')

效果

使用colorcet的cmp

需要先安裝colorcet：

pip install colorcet

使用方法和上面幾種方法類似，若想使用colorcet的colormaps中的hot:

mesh.plot(scalars=name, cmap=“hot”)

代碼

def mesh_cmp_colorcet(mesh, name):
 """
  使用進(jìn)行colorcet進(jìn)行色彩映射
  :param mesh: 輸入mesh
  :param name: 比較數(shù)據(jù)的名字
  :return:
 """
 pts = mesh.points
 mesh[name] = pts[:, 1]
 mesh.plot(scalars=name, cmap=colorcet.fire)
 
if __name__ == '__main__':
 mesh = pv.read('vtkData/airplane.ply')
 mesh_cmp_colorcet(mesh, 'y_height')

效果：

總結(jié)

pyvista相當(dāng)強(qiáng)大，而且比直接用vtk更加方便（代碼量肉眼可見的降低?。?/p>

到此這篇關(guān)于Python利用PyVista進(jìn)行mesh的色彩映射的實(shí)現(xiàn)的文章就介紹到這了,更多相關(guān)PyVista mesh色彩映射內(nèi)容請搜索腳本之家以前的文章或繼續(xù)瀏覽下面的相關(guān)文章希望大家以后多多支持腳本之家！