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pandas提升計算效率的一些方法匯總

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前言

Pandas是為一次性處理整個行或列的矢量化操作而設計的,循環(huán)遍歷每個單元格、行或列并不是它的設計用途。所以,在使用Pandas時,你應該考慮高度可并行化的矩陣運算。

一、避免使用for循環(huán)

盡量使用列號或者行號進行矩陣檢索,避免使用for循環(huán)。

1.1使用for循環(huán)

import os
import pandas as pd
import datetime

path = r'E:\科研文件\shiyan\LZQ\LZQ_all_sampledata.csv'
def read_csv(target_csv):
    target = pd.read_csv(path,header=None,sep=',')
    return target

start_time = datetime.datetime.now()
a = read_csv(path)
for i in range(10000):
    b = a.iloc[i]
end_time = datetime.datetime.now()

print(end_time-start_time)

耗時:0:00:02.455211

1.2使用行號檢索

path = r'E:\科研文件\shiyan\LZQ\LZQ_all_sampledata.csv'

def read_csv(target_csv):
    target = pd.read_csv(path,header=None,sep=',')
    return target

start_time = datetime.datetime.now()

a = read_csv(path)

b = a.iloc[10000]

end_time = datetime.datetime.now()

print(end_time-start_time)

耗時:0:00:00.464756

二、使用for循環(huán)的條件下提高效率

2.0 如果必須使用for循環(huán)如何提高效率

我們可以做的最簡單但非常有價值的加速是使用Pandas的內(nèi)置 .iterrows() 函數(shù)。

在上一節(jié)中編寫for循環(huán)時,我們使用了 range() 函數(shù)。然而,當我們在Python中對大范圍的值進行循環(huán)時,生成器往往要快得多。

Pandas的 .iterrows() 函數(shù)在內(nèi)部實現(xiàn)了一個生成器函數(shù),該函數(shù)將在每次迭代中生成一行Dataframe。更準確地說,.iterrows() 為DataFrame中的每一行生成(index, Series)的對(元組)。這實際上與在原始Python中使用 enumerate() 之類的東西是一樣的,但運行速度要快得多!

生成器(Generators)
生成器函數(shù)允許你聲明一個行為類似迭代器的函數(shù),也就是說,它可以在for循環(huán)中使用。這大大簡化了代碼,并且比簡單的for循環(huán)更節(jié)省內(nèi)存。

當你想要處理一個龐大的列表時,比如10億個浮點數(shù),問題就出現(xiàn)了。使用for循環(huán),在內(nèi)存中創(chuàng)建了大量的內(nèi)存huge列表,并不是每個人都有無限的RAM來存儲這樣的東西!

生成器將創(chuàng)建元素時,僅在需要時將它們存儲在內(nèi)存中。一次一個。這意味著,如果必須創(chuàng)建10億個浮點數(shù),那么只能一次將它們存儲在內(nèi)存中。Python中的range()函數(shù)使用生成器來構(gòu)建列表。

也就是說,如果你想多次迭代列表并且它足夠小以適應內(nèi)存,那么使用for循環(huán)和range函數(shù)會更好。這是因為每次訪問list值時,生成器和range都會重新生成它們,而range是一個靜態(tài)列表,并且內(nèi)存中已存在整數(shù)以便快速訪問。

2.1使用range

import os
import pandas as pd
import datetime

path = r'E:\科研文件\shiyan\LZQ\LZQ_all_sampledata.csv'

def read_csv(target_csv):
    target = pd.read_csv(path,header=None,sep=',')
    return target

start_time = datetime.datetime.now()

a = read_csv(path)

for data_row in range(a.shape[0]):
    b = a.iloc[data_row]

end_time = datetime.datetime.now()

print(end_time-start_time)

耗時:0:00:07.642816

2.2使用 .iterrows() 代替 range

import os
import pandas as pd
import datetime
path = r'E:\科研文件\shiyan\LZQ\LZQ_all_sampledata.csv'

def read_csv(target_csv):
    target = pd.read_csv(path,header=None,sep=',')
    return target

start_time = datetime.datetime.now()

a = read_csv(path)

for index,data_row in a.iterrows():
    b = data_row

end_time = datetime.datetime.now()

print(end_time-start_time)

耗時:0:00:03.513161

三、使用.apply

iterrows()函數(shù)極大地提高了速度,但我們還遠遠沒有完成。請始終記住,當使用為向量操作設計的庫時,可能有一種方法可以在完全沒有for循環(huán)的情況下最高效地完成任務。

為我們提供此功能的Pandas功能是 .apply() 函數(shù)。apply()函數(shù)接受另一個函數(shù)作為輸入,并沿著DataFrame的軸(行、列等)應用它。在傳遞函數(shù)的這種情況下,lambda通常可以方便地將所有內(nèi)容打包在一起。

參考鏈接

四、其他方式

博客鏈接

總結(jié)

到此這篇關于pandas提升計算效率的文章就介紹到這了,更多相關pandas計算效率內(nèi)容請搜索腳本之家以前的文章或繼續(xù)瀏覽下面的相關文章希望大家以后多多支持腳本之家!

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